在刘朗针对宣抚司军政进行大刀阔斧的改革前夕，阮小五、萧恩再次提出退养的申请，他考虑到两位前辈确实年龄大了，就正式批准了他们的请求。加上早已淡出军政舞台的萧让和金大坚，意味着梁山老一辈，彻底退出历史舞台了。刘朗特别任命四位前辈为讲武堂荣誉教授，关照他们退养之时，多到讲武堂走走，发挥余热，给基层军官传授一些经验。
阮小五和萧恩退养之后，就隐居在台北，以教养孙辈为乐。萧让和金大坚都是孤身一人，他们也一直以刘府下人自居，因此，还是和以前一样，居住在侯府，顺便帮着刘朗处理一些机密事。
军制改革大方向确定以后，宣抚司主要文武官员磋商，最后决定：水师扩编为四个舰队，每支舰队两万人，辅助军五千人，主战军一万五千人；骑兵分设两个团，每团六千人；特种军六千人、救护军两万人、预备军五万人；步军设军团制，每个军团一万人，设五营，两营辅助军四千人，三营主战军六千人，其中主战营由两营神机军和一营传统兵种组成。
讨论通过后，刘朗立即签发调令：
水师第一舰队统领张宾，副统领李登，管辖两浙路沿海至台湾北端海域；第二舰队统领张云，副统领罗延庆，管辖整个台湾海峡，以及台湾南部海域；第三舰队统领严成方，副统领阮良，管辖吕宋岛周边，及南洋海域；第四舰队统领石俊，副统领萧桂英，管辖济州岛、虾夷岛周边，以及北方海域。
步军一军团统领呼延钰，二军团统领徐晟，三军团统领史鹏，四军团统领林天龙，五军团统领曹保，六军团统领汤艾，七军团统领韩启凤，八军团统领凌威，九军团统领阮义，十军团统领穆岩，十一军团统领鲁平，十二军团统领武南，十三军团统领韩启龙，十四军团统领刘守义，十五军团统领林天宝，十六军团统领杨国良，十七军团统领索志，十八军团统领李飞，十九军团统领石雪松，二十军团统领樊成，二十一军团统领邓肖雄，二十二军团统领展鹏飞，二十三军团统领孙猛，二十四军团统领刘益，二十五军团统领冼成功。其中一军、二军驻扎台中；三军、四军驻扎台南；五军驻扎济州岛；六军、十四军、二十军、二十一军驻扎广南东路；七军、二十二军、二十三军、二十四军驻扎广南西路；八军、九军、十军、十一军驻扎福建路；十二军、十三军、二十五军驻扎台北；十五军、十六军、十七军、十八军、十九军分驻五岭。
水师陆战队一军团统领花雨，驻扎济州岛；二军团统领伍尚志，驻扎虾夷岛；三军团统领严奇，驻扎舟山群岛。
特种军统领杨雄，副统领刘昕，分驻福建路、台湾路；骑兵一团统领杨再兴，二团统领岳雷，驻扎台湾；救护军统领李玉良，副统领柴青芝、木子青；协从军统领原田次郎，副统领冈本、佐藤；驻扎台北；情报军更名情报局，统领时宾，副统领木子燕；预备军统领张大力，驻扎台北训练营。
军制改革完成之后，刘朗又针对宣抚司军政架构，进行了完善。宣抚司这个框架是朝廷设置的，如今还要扛朝廷这面大旗，不能废止。为了更好的决策，刘朗在宣抚司框架之外，新设了一个军机处，总揽宣抚司内日常军政事务，决策大政方针。任命虞允文为首席参议，武定国、张达、方恩全、水泽乡、吴能、朱貌为军机参议。
如今刘朗的羽翼已经丰厚，具备了与朝廷分庭抗礼的实力，刘家嫡支合议后，决定退出商界。刘朗的亲族，东方家也顺势退出了商界，徐家因为家业庞大，转变不易，刘朗岳父徐烈把家族商业主导权交给了二弟，自己这一支不再从事商业。刘朗的师兄杨全有，也名下一些产业变卖，阖家搬迁到了台湾。
刘朗把原制造局、造船局、复兴出版社收归宣抚司所有，致远船行和刘家船行合并，依然取名致远船行，也归并宣抚司掌管。为了细化宣抚司行政管理，在宣抚司下设：工业局，总管秦峰，副总管周工；商务局，总管刘谦，副总管东方野；海贸局，总管徐烈，副总管刘让；交通局，总管杨全有，副总管刘恭；船舶检验局，总管杨勇；海关总署，总管徐亮、副总管刘晟；文华总署，总管崔忠信；致远船行，总管刘伟，副总管刘崇；船舶制造厂，总管刘艺。
在大范围革新宣抚司军政制度的时候，也有些狂热分子，纷纷上书，请求刘朗正式称王。这股苗头，迅速被刘朗压制下去了。虽说，宣抚司如今实力庞大，足以与朝廷分庭抗礼，但为了将来的统一大业，不致过早的发生内战，朝廷这面大旗，还要扛一段时间的。