1601年，四旗主：正黄旗：旗主野猪皮
正白旗：旗主野猪皮长子褚英
正红旗：旗主野猪皮次子代善
正蓝旗：野猪皮弟弟舒尔哈奇
1615年，扩为八旗：
正黄旗：旗主野猪皮镶黄旗：旗主野猪皮
正白旗：旗主野猪皮第八子皇太极
镶白旗：旗主野猪皮十二子阿济格
正、镶红旗：旗主野猪皮次子代善
正蓝旗：旗主野猪皮侄子阿敏
镶蓝旗：旗主野猪皮第五子莽古尔泰
野猪皮生前的八旗旗主大致是这样的
正黄(45牛录)和镶黄(20牛录):野猪皮
正白旗(25牛录):皇太极
镶白旗(15牛录):褚英之子杜度
正红旗(25牛录):代善
镶红旗(26牛录);代善长子岳托
正蓝旗(21牛录):莽古尔泰
镶蓝旗(33牛录):阿敏
每三百人编一牛录，每牛录置一牛录额真（佐领）；下设代子二人、章京四人、拔什库四人，每一牛录组成四个塔坦，即村落，由一名章京、一名抜什库管理。每五牛录立一甲喇额真（参领）；每五个甲喇组成一个固山（旗），设固山额真一人、梅勒额真二人，固山额真亦称为旗主。每固山有丁七千五百名，这时，满洲军队的编制基本成形了。旗丁中按照身份地位，分为阿哈、披甲人、和旗丁三种。阿哈即奴隶，多是汉人、朝鲜人；披甲人是降人，民族不一，地位高于阿哈；旗丁是女真人。
护军（满语bayara，音译摆牙喇），分白甲护军（白摆牙喇）、红甲护军（红摆牙喇），为八旗军精锐，战斗时一般跟随在汗、贝勒等大贵族身边，御前兵应为后金汗亲随护军。后来则进一步细分，除汗、贝勒的亲随护军外，还将其他护军以旗为单位，组成护军营，一般以贝勒为统帅。
行营兵在天聪三、四年常以甲兵（满语uksin，音译乌克申，又称甲士、披甲）指代，大约包含了披重甲陷阵和披轻甲步射这两种战兵，统帅一般为固山额真。通常意义上的披甲兵包括护军和行营兵两部分。
无甲兵在此时常以步兵指代，为自由民身份的参战壮丁，无甲并非说无甲胄兵械，而是指并非披甲兵，参战多以自愿为原则，此时的满洲人往往以“抢西边”为人生目标，征战抢掠欲望较强。同时，每牛录出甲若干，既是义务，也是权利，即后金基本以每牛录出甲数分配抢掠所得，不是想当披甲就一定能成为披甲。
无甲兵出战，获得的赏赐也不如披甲兵。厮卒（满语kutule，音译库图勒，也称厮役、跟役），也就是由奴仆担任的辅兵，将领、护军有较多厮卒，但行营兵并非全部都有厮卒，无甲兵则基本无厮卒跟随。但总体而言，厮卒与披甲兵的比例应达1：1。
汉八旗：
清太祖野猪皮将降服的汉人编成十六个佐领，隶满洲八旗。明崇祯四年（1631），皇太极为平衡八旗旗主诸贝勒的军事势力，
以汉人精于火器，拨出汉人别置一军，名“乌真超哈”（“乌真”，汉语“重”的意思，“超哈”，汉语“兵”或“军”的意思），佟养性为昂邦章京（总管）。