1573年4月由于武田信玄的死，信长包围网出现了一个突破口。信长迅速在岐阜集结兵力，并命手下的丹羽长秀在近江附近的琵琶湖建造大船，准备水陆并进消灭在京都二条城公然反叛的足利义昭。1573年7月，100只大船建造完成，加上返回的援助德川的兵力，信长集结了2万之众。在这期间，他也接待了来自武田家的使者，武田二十四将之一的小山田信茂。由于信长在1568年上洛的时候曾跟武田信玄结盟，所以武田家对三方原之战信长派援军支持德川家表示不满，特派使者来准备与织田家正式宣战。信长也知道自己想要夺取天下，武田是必须打败的对手，也就接受了。不过对方使者的礼物却让信长黯然泪下，那是在三方原之战牺牲的平手泛秀（平手政秀三男）的首级。但相反的这件礼物也激励了织田军的士气。
得知武田军撤退的足利义昭，依然没有放弃抵抗。一方面加紧联系浅井、朝仓等反信长势力，一方面也不断的向松永久秀寻求援军。足利义昭手里不过几千人，所以最后决定逃离二条城。7月6日信长登上造好的大船，从水路出发，只用一天就到达二条城，二条城守将三浏藤英奋力反抗，但还是最终不敌，城池于7月12日陷落。这时的足利义昭已经逃到了自己认为固若金汤的槙岛城。这几天连降大雨，义昭在城中喝着闷酒，心情怎么也好不起来。而城外，信长一马当先，带领着织田军渡过了槙岛最后的屏障——宇沼川。在信长的猛攻下，槙岛城2日就陷落了。
信长活捉了足利义昭，本意杀了这个小人。但曾经是义昭部下的明智光秀和细川藤孝极力反对，一时难以抉择。两人看说服不了信长，立刻向上请示天皇，最后由天皇来调停此事。结果由足利尊氏开创了190多年的室町制幕府正式灭亡，足利义昭遭到了放逐。
这件事震动了整个日本，之前反叛的松永久秀等人再次归降了信长。许多家臣怕其日后再反，建议信长傻吊久秀。信长笑言：“久秀是个枭雄，谁强自然就会归附谁，谁强就能借用他的力量，现在还不是跟他作战的时候。“京都地区基本已经平定，信长交给村井贞胜留下料理京都的后事。自己又乘船来到了身处北近江正与浅井长政对峙的虎山御前城堡。
在此负责对浅井家攻略的正是猴子——木下藤吉郎。通过这段时间的攻略，猴子已经把浅井的小谷城完全包围，并说降了浅井家的重臣阿闭贞征。信长特意叫来了竹中半兵卫，三人一起商量对策。半兵卫说道：“现在我们跟浅井呈围城之势并在不断调略对方的武将，但是能挖过来的已经都挖过来了，剩下的海赤雨三士等人都是死忠于浅井的家臣；另外我们也多次派人与阿市大人联系，但都一无所获，如果攻城战中误伤了您的妹妹那就不好了。”猴子插嘴道：“是啊，最让人担心的还是阿市大人。”信长说：“长政是我很欣赏的年轻武将，如果不是他父亲久政复归，也许还不至于背叛我，有什么办法能劝他投降呢？”半兵卫回答道：“依在下看，不太可能，长政虽重义，但更重孝。如果使其降服，必要先说服其父久政，但此事难如登天。”正在三人苦恼之际，负责探查朝仓家动静的柴田胜家来了。
“信长大人，最新消息！朝仓义景不听家臣们的劝阻，派出2万大军前来援救小谷城！”半兵卫笑道：“名门朝仓家的劫数到了”，信长不解，“我知道大人用兵迅速，在京都打败义昭后，肯定会转向浅井和朝仓，不给他们喘息的机会。所以不久前与木下大人商量，特意放跑了浅井派去朝仓家求援的使者。朝仓家祖上均为名将，老将朝仓宗滴70高龄还曾征战沙场，虽经历几败但还不以动其根本。所以必须将其军队诱出越前，进而消灭。可惜现在的当家朝仓义景在父辈的溺爱中长大，是名浪漫主义诗人，必会倾全家之力来救援浅井的。”听完半兵卫的计策，信长钦佩不已，有着这样能配合自己行动的家臣真是难能可贵。“好吧，那就先打朝仓，我们在这以逸待劳，围点打援。胜家，说说详细的情况吧。”