李云天去年出征时，龙江船厂并入讲武堂的相关事宜就已经开始进行，时至今日讲武堂已经完成了对龙江船厂的整合，其中最重要的事情莫过于船厂官员的人事变动。
既然龙江船厂已经成为了讲武堂的下属产业，那么李云天自然要把讲武堂的人安排在龙江船厂的显要职务上。
不过，李云天并没有撤销龙江船厂那些大大官员的职务，例如专门负责造船事务的工部员外郎、主事、提举等官员，以及帮工指挥、厢长和作头等低级官吏、班头悉数留任。
他采取了改变龙江船厂权力构架的方式使得讲武堂派下来的人员掌握了龙江船厂的大权，不仅在龙江船厂成立了一个最高衙门――龙江船厂董事局，而且将船厂原先的管理体系打散重编，在董事局下面设立了设计司、建造司、采购司、后勤司、保安司和政务司六大部门。
其中设计司负责船舶的设计，建造司负责建造，采购司负责物品的采买，后勤司复杂保障生活、保安寺负责安全、政务司负责对外事务并协助董事局管理龙江船厂。
在这六大部门中，职权最重的自然是政务司，而责任最重的非建造司莫属。
按照李云天的设置，六大司的最高长官为司长，从五品的武职，副司长是正六品的武职，下属各部门的官员的官阶依次下调。
龙江船厂原来的官员和工匠主要集中在设计司和建造司里，毕竟他们是专业的造船者，讲武堂的人无法取代，而且设计司和建造司的司长也都由原来的船厂的工部主事担任。
至于政务司、采购司、后勤司和保安司的官吏基本上都是李云天从讲武堂政务堂下辖的农厅、户厅、礼厅、军厅、工厅和刑厅里调派过去的，他们是李云天掌控龙江船厂的核心力量。
虽然李云天做出了让龙江船厂的官员悉数留任的决定，但并不是所有人都希望纳入讲武堂的麾下，从文官变成武官。
因此，方有节的副手，协助他处理龙江船厂事务的一名工部员外郎，以及两名工部主事和数名工部的官吏选择离开，调回工部候任。
在工部往龙江造船厂派遣的督造官中，正六品以上的一共有六个人，既一名正五品的工部郎中、一名从五品的工部员外郎和四名正六品的工部主事。
随着那名工部员外郎和两名工部主事的离去，龙江船厂的上层权力机构可谓轰然倒塌，这倒给李云天的人事安排提供了不少便利。
其实，李云天本以为方有节也会选择离开，毕竟文官们历来轻视武官，以方有节的资历回到工部后肯定能外放一任知州乃至知府，万万没想到他会留下来。
后来李云天才知道方有节自从进入工部后就一直在龙江船厂任职，在龙江造船厂有着非常高的威望，由于他对龙江船厂有一种特殊的感情故而宁愿舍弃文职而加入武职。
正是在方有节的劝下，另外两名工部主事才选择留下，这无形中启动了稳定龙江船厂民心的作用。
鉴于方有节在龙江船厂的特殊地位和作用，李云天于是让他担任龙江船厂的厂督，全面负责龙江船厂的事务，给了他很大的权限，专门负责与龙江船厂董事局沟通。
龙江船厂董事局一共有五名董事，其人员组成为一名皇族、一名讲武堂官员、一名南京工部官员、一名南京户部官员和一名南京都察院官员。
在李云天的设置中，董事局是龙江船厂的最高决策机构，负责审核龙江船厂的重大事务，但是不参与到龙江船厂的日常管理事务中去。
每当遇到重大经济和政务上的决策时，作为龙江船厂厂督的方有节都要向董事局进行汇报，阐明其中的利害得失关系，然后五名董事局董事进行表决，如果超过一半人同意就可以执行这项决策。
由于皇族成员身份尊贵，故而在董事局中担任负责召集事务的总董事，主持董事局会议的召开，但是手中的权力与其他四名董事相同。
李云天之所以要在方有节头上设立一个董事局，是为了建立一套切实可行的监督和制约体系，如此一来龙江船厂可进入良性发展。
值得一提的是，龙江船厂董事局的董事并不是随随便便就能当上的，李云天每年都会董事局所决定的政策进行评估，如果评估不合格的话其中的一些人要被撤换，并且受到惩罚。
之所以李云天选择了南京户部、南京工部和南京都察院的官员来担任董事，不仅因为他们是各自领域的专业人员，能对方有节的提出的决策进行专业的判断，还有另外一十分重要，那就是他们住在南京城，距离龙江船厂很近。