电影一开始就是一段爱丽丝的录像独白，简单回顾了第一部的剧情。
这一段独白其实是后面剧情中记录了浣熊市真相的录像带里截取出来的，所以其实是对白而不是旁白，用在片头十分自然，又埋下了一个很好的伏笔，可见导演和编剧的心思。
自此之后的每一部续集，开头都会有一段爱丽丝的独白来带观众回顾前作的剧情，句式和第二部的开场白高度吻合，但都是额外拍的旁白，所以虽然似曾相识，但始终给不了观众当初的那种感觉。
开场白之后，导演用了十分明快的节奏讲述了保护伞的新一波便当小分队打开了蜂巢，放出了里面的丧尸，然后保护伞公司迅速撤离要员等等情节。
这一段里面拍到了发明T病毒的阿什福德博士的女儿在撤离途中因为撞车而滞留在浣熊市的剧情，但是并没有详细讲述，给观众留下了一个很大的悬念。
接下来本系列的第一个游戏人物吉尔上线，造型和游戏里非常像，令人眼前一亮。
饰演吉尔的西耶那·盖尔利也成为了观众对本系列出现的游戏人物里最为好评的一位演员。
跟着讲到浣熊市生化危机全面爆发，第二位游戏角色卡洛斯登场。
这位小哥在第三部也出场了，还和爱丽丝有感情戏，本来大有机会扶正当男主角。
但可惜被无情发了便当，这是后话，暂且按下不表。顺带表扬一下，这一部的导演有一点做得非常出色，那就是在剧情上和第一部的衔接非常紧密。
影片在交代浣熊市爆发生化危机的情节时沿用了第一部最后爱丽丝从浣熊市医院逃出来的片段，强调了这一部和第一部的联系与交集，使得这部电影没有后面几部续集的割裂感。
之后剧情讲到在离开浣熊市的唯一通道处也出现了感染者，保护伞公司小头目决定关闸门把所有市民关在城里。
T病毒的发明者阿什福德博士因为女儿安琪拉没有跟来而拒绝撤离，留在浣熊市外围用电脑搜索幸存者，希望借他们的力量找到自己的女儿（按照好莱坞编剧的理解，好像搞科研的都自带黑客技能OTL）。
吉尔、便当男警察和女记者组成了一号求生小队，躲进了一个教堂里。这一段剧情十分恐怖，教堂里有个神父居然用死人喂他变成了丧尸的妹妹，真是相当重口味。
跟着第一部的BOSS舔食者组团进了教堂作威作福，但是被拉风无比的爱丽丝开着摩托车冲了进来轻而易举就triple kill了。
由于第一部赚了不少，第二部的预算也多了，所以动作戏增加了不少，导演真是不遗余力地给爱丽丝耍帅的机会。好在剧情足够丰满，动作戏虽多但是没有喧宾夺主，反而增色不少。
卡洛斯和他的两位便当队友组成了二号求生小分队，在生化危机全面爆发的浣熊市中挣扎求存。
其中一个便当队友名字居然叫做尼古拉，想必应该就是生化危机3游戏里被追踪者杀死的那位吧。
二号求生小分队发现了一台直升机把两箱东西扔在了浣熊市医院，于是便追去了查看，但原来那是保护伞公司为了实施“复仇女神”计划而扔给医院里的追踪者的武器。
除了一、二号求生小分队之外，还有一个三号求生小分队，只有一个成员L.J。这个小黑哥毛用都没，就是来搞笑的，承担了全片所有笑点。
他躲到了一个（特种战术救援小组）成员的据点，但是不幸遇上了本集的大BOSS来推塔，然后又有幸亲眼目睹了神装追哥N杀暴走。
那边厢招了女主角爱丽丝入队的一号求生小分队接到了阿什福德博士打来的电话，接到帮阿什福德博士找女儿的任务，同时得知了天一亮保护伞公司就会用一颗核弹毁灭整个浣熊市。
一号小分队在找博士女儿的路上遇上了追哥，爱丽丝身上有主角光环知道自己不会死，便叫队友先走，自己和追哥一言不合就干了起来。
由于爱丽丝被T病毒改造过而获得了超乎常人的反应和力量，再加上主角光环加持，在六神装的追哥面前居然还是极限逃生了。
三个求生小分队最终在博士女儿的学校找到了博士的女儿安琪拉并成功会合，途中当然损失了一些队友，但这并不重要。
反正最后爱丽丝及时出现，听安琪拉讲解了她爸爸发明T病毒的来龙去脉，顺便给被咬的卡洛斯打了解药。
完成任务的求生小队急忙赶去了撤离点，途中爱丽丝就录下了电影开场时那段独白，然后就是一组非常帅的动作戏，当然又是爱丽丝的个人表演时间。
只不过原来这个撤离点是个陷阱，阿什福德博士已经被保护伞的小头目抓住，而这都是为了复仇女神计划的最终测试，也就是让裸装的爱丽丝和追哥单挑看看谁比较能打。
一场恶斗之后，点了主角光环的爱丽丝取得了胜利，但却突然想起了追哥原来就是第一部和她一起从蜂巢逃出来的马特，瞬间泪奔，然后就放弃补刀了。
就在爱丽丝准备受死时，追哥突然良心发现捡起装备怒干了保护伞的守卫，然后还献祭了自己帮爱丽丝逆转了战局，抢到了直升机离开了浣熊市。
但直升机在核爆的冲击下坠落在浣熊市郊外，之后爱丽丝（未知生死）也被保护伞的人带走了。