但近年来，各国官方对UFO的兴趣明显冷淡，继美国政府和军方中止为UFO研究拨款后，2001年，英国UFO研究所黯然关门，2004年俄罗斯的专门研究机构也无疾而终，至此全球范围内官方UFO研究机构仅剩法国一家，这也是此次法国公布纪录引起全球轰动的原因之一。
各国官方冷淡UFO原因大同小异。在美国，许多政治人物认为，UFO研究除了让一些人借此发财外并无意义；在英国，UFO官方研究一开始就有强烈的防空现实色彩，在确认这些UFO现象对英国空防毫无威胁后就失去了调查的兴趣，政治家们普遍认为，让众多专家面对无数捕风捉影的空穴来风瞎忙、或聚集在一处无所事事，是对国家资源和纳税人金钱的巨大浪费，就连一直坚持官方研究的法国，许多专家也指出，某些UFO报告充满了荒诞，毫无可信之处。此外，许多UFO现象实际上是军方秘密飞行、导弹试验或卫星、飞船碎片，业余研究者不明所以，但官方对此却一清二楚，因此他们认为这种研究劳民伤财意义不大，纷纷退出，也就不难理解了。
在专家中，对UFO现象也有很多争议，一些否认UFO存在的人士认为，UFO现象只不过是人的幻觉，或是对某些自然现象的一种曲解，可以用天文学、气象学、生物学、心理学、物理学和其他科学知识来加以说明，激进者甚至把飞碟学视为伪科学；而肯定UFO现象存在的人则援引大量UFO纪录进行反驳：自47年至今，仅美国一国存档的UFO目击记录即超过10万起。
更多的学者指出，UFO本身的含义是“不明飞行物”，在各类纪录中可大致分为五类：一、已知飞行物体或已知自然现象、已知生命物质，例如气球、飞艇、人造卫星火箭残骸、昆虫群、飞鸟等；二、特定环境下一些社会群体或个人的幻觉、心理现象；三、未知的自然生命，生物学家认为大自然中除了固态、液态、气态外应还有第四生命，但这点还未经证实；四、未知的自然现象，如地光火球、球状闪电、等离子体；五、人们不能制造、不能完全认识的智能飞行器或飞行物，也就是人们常说的“飞碟”、“外星人”，其中第五类仅占极少比例，且至今无一例可以证实。至今，不论官方还是民间，UFO研究都仅限于“收集目击证词并辨别真伪”的层次，且由于UFO现象的偶然和不可重复性，对真伪的辨别也存在许多困难。
尽管如此，由于几十年来包括好莱坞影片和媒体的广泛渲染，以及众多UFO爱好者对人类尚难解释现象的好奇和痴迷，UFO研究在民间仍具有相当活力，美国1987年的调查显示，一半的美国人相信UFO真的存在，有3500万美国人坚称自己亲眼见过UFO，相信飞碟存在的人中包括前总统杜鲁门和宇航员库珀等。如今在五大洲60多个国家存在着各类民间UFO研究组织，他们的研究方法大同小异：尽可能广泛地布置观测点，观测并搜集UFO目击报告，对这些报告进行科学分析和研讨，通过杂志、研讨会和网络进行成果交流和发布。由于互联网的普及，不同组织间的协同、合作和资料交换也成为可能和经常的行为。