尽管此时奇才队的进攻势头已较全明星赛之前有所减缓，正处于一个冲击季后赛的关键时期，但主帅科林斯仍旧认为乔丹应该静心休养，使身体得到全面恢复，至于是否需要复出，何时复出，还需要从长计议。因此，在2月27日至3月18日的这段时间里，乔丹缺阵了球队的12场比赛，丧失了主心骨的奇才队在此期间遭受了8负4胜的沉重打击，似乎他们离季后赛越来越远了。
心急如焚的乔丹再也坐不住了，3月20日，他向科林斯主动请缨出战，加入凶险漫长的客场之旅，远赴丹掘挑战掘金队。尽管是役乔丹只拿到了7分1个篮板2次助攻，但他带给球队的精神力量是无穷的，奇才最终以107比75痛宰对手。只是舟车劳顿以及比赛的超高强度令初愈的乔丹不胜负荷，一天之后他即再度缺席了客场与老对手爵士队的短兵相接，奇才也以79比94抱憾而归。
随后，乔丹又拖着一副抱病之躯出战了5场比赛，奇才队取得了两胜三负的战绩，仍旧没有什么大的起色和改观。4月2日主场与湖人队一役，乔丹的身体再也难堪重负，他的膝盖再次发炎了。整场比赛他上场12分钟，打破了86年3月与雄鹿一役出场13分钟的最低出场时间纪录。他全场5投1中只拿到2分，同样创下了职业生涯新的最低得分纪录。随即乔丹草草收场，他坐在板凳上看完了奇才被科比和奥尼尔的任意蹂躏，他们以20分之差惨然败北，尽管他仍旧有心杀敌，却也已经无力回天了。
此役过后，奇才实则已失去了挑战季后赛的资本，乔丹赛季之前为球队制定的晋身季后赛的目标变成了泡影。第二天，他对外宣布了放弃剩余8场比赛，提前结束本赛季的决定，因为即使他不顾膝伤继续停留在球场上，最后的挣扎也已失去了任何意义。
这是否是一个留有余势的决定，乔丹将把剩下的时间用来恢复和静养，他在为自己的下赛季做各方面的准备吗人们都在猜测着答案。尽管两个月前，乔丹曾经做过明年仍然为奇才队打球的表态，但不到最后一刻谁又能真正完全解读他的心思呢不过大多数人不相信这位历史上最伟大的球星会以一场创造了职业生涯最低得分纪录的比赛作为自己的告别演出，人们宁愿期待他下一季仍会出现在赛场上，这也成为奇才球迷聊以的一个理由，今年不行还有来年，乔丹始终是他们心中不灭的一盏导向明灯。
39岁的乔丹与01赛季提前作别了，在他参加的全部60场常规比赛里，有37次成为全队的得分王，有11场比赛他的得分达到了30分至39分之间，5次得分超过40分，他在本赛季的最高得分是在与黄蜂一役中赚得的51分。
奇才队最终以37胜45负的常规赛战绩倒在了季后赛的大门之外，毫无疑问，指望一支只在一个赛季之前尚混迹于末流的超级滥队转眼发生质变，登堂入室是不现实的，即使这是一支乔丹的球队也不行。乔丹的确已不是当年那个能够执掌一支球队前途和命运的飞人了，但人们不应对他带给奇才队的重大改观视而不见