最早的深海栖舰毫无疑问地源于地球，最早出现的时代不明，但可以确定不会晚于一战，尤其是在德军的无限制潜艇战开始后。至于为何直到一战才会形成深海栖舰，具体原因尚不明朗。已确认的源于地球的深海栖舰最早记录为日德兰海战中沉没的不倦级战巡“玛丽女王”所化的XV型战巡。在地球形成的深海栖舰最晚纪录此前一直被认为是二战结束后，1946年的“十字路口行动”，但根据日本海军樱庭晓上将的报告，在日美联军收复阿留申海时发现了推测沉没时间为1970年以后的特型驱逐舰Верный转化成的战舰レ级（美称σ型战列舰）。
深海栖舰的本体是思念，其中绝大多数是怨恨。无论源于地球还是此世，任何不是死于/沉没于正面战争的人、军舰、飞机均会产生怨恨，其中尤其是主力舰的思念或怨恨，往往强大到足以形成高级深海栖舰。比较微弱的人类、试验舰艇、商船的怨念则会就近、趋同混杂起来，形成更低级的深海栖舰。话虽如此，实际上只要是舰船或舰娘的怨念均有可能形成高级深海栖舰，只不过战列舰的怨念更容易形成深海战舰、航母的怨念更容易形成深海空母的对应而已，毕竟高级深海栖舰会保留生前的技术能力，术业有专攻。
据推测，深海栖舰在形成后本应立即攻击地球的海洋，但由于某些未知的原因依然蛰伏于深海，直到一战结束后，由于人类的祈愿——尤其是二战期间的山口多闻和另一位不知名的日本军官在赴死之时的态度，使她们彻底离开地球，并来到了此世。由于此世并没有做好对付她们的准备，因此深海栖舰很快便开始了攻击。
自深海栖舰出现在此世以来，举凡被击沉于海中的人类、舰艇、也包括舰娘甚至深海栖舰本身，其所含的怨念也会产生深海栖舰。足够强大的高等深海栖舰可以借此原理复生，甚至不止一次，直到其思念被反复沉没的经历扰乱才会弱化。深海栖舰也可以依靠此种方式进行增员，而且——依照日本海军横须贺镇守府的舰娘报告，深海栖舰之中确实存在有会对沉没的舰娘进行**的微型亡灵存在，或许意味着她们是知晓并利用这被称为“深海栖舰化”的现象的。
依照日本东京的深海栖舰研究中心的说法，深海栖舰可以分为五类：最强的深海栖舰往往由单一的怨念/思念所化，拥有完整的人类外形、前世的记忆和战术能力，相应也可以和人类交流，称为高级亡灵类；与高级亡灵战斗力相仿、但往往由两到三个相近的怨念/思念集合而成、在完整的人类外形以外还多出了足以喧宾夺主的海兽部分，对前世的记忆比较模糊，心智并不十分健全（显得比较幼稚，而非不定时爆发），称为高级共生类；由单一的怨念所化但因为怨恨过强而丧失绝大多数理智的深海栖舰，虽然也拥有完整的人类外形，但一般情况下一部分身体会被隐藏起来（如潜艇的下半身，和轻巡的面部），称为低级缚灵类；由多于5个相近的怨念/思念集合而成的深海栖舰，往往只有少部分身体是人类外形，其余部分是怪兽，称为低级共生类；由更多的怨念/思念集合而成、除了“恨”以外没有任何一致性的深海栖舰，往往只是单纯的海怪而已，称为奇美拉类。一般前三者又被美国的学者称为人形深海栖舰（humanoidtype），低级共生类深海栖舰又被称为半人形（semi－humanoidtype），合成兽类又被称为非人形（non－humanoidtype）。
除了此种区分之外，亦有按照主炮射程区分深海栖舰的方式，即：炮击有效射程低于10海里的归类为驱逐，有效射程介于10——15海里的归类为巡洋，有效射程大于15海里的归类为战列舰，潜水雷击的称为潜艇，装备为飞机且不装备主炮的归类为航母。不过这种归类在面对某些特殊深海栖舰时失去了作用。此外，深海栖舰还存在有某些陆基或海上浮标类的“基地型”大型亡灵，她们则是被单独划分出来。
绝大多数深海栖舰都会随着击杀舰船、舰娘或其他武器和人类而获得更强的灵压、威力更大的装备。一般来说是存在着血红色灵光的精英（Elite）深海栖舰和金色灵光的旗舰（Flagship）（英美称冠军Champion）深海栖舰，而强大到足以“改装”的深海栖舰则会在正常的旗舰灵光之外，眼中冒出强烈的海蓝色火光，智慧也会大大提升。但是，也有着不适用于此规则的深海栖舰存在。其中包括上面所说同时拥有主炮、鱼雷和舰载战斗机的人形深海栖舰中的大部分，也包括所有的基地型深海栖舰。其中，除了一些发出微弱血红色灵光、浮标式的海上要塞属于非人形之外，其余都是人形。人形的家伙当中，发出血红色灵光的称为鬼舰（Demon），发出强烈火红色火光的称为姬舰（Devil）——在这里，亚洲诸国与欧美不同，欧美不把人形的基地类深海栖舰划入鬼姬之列，而亚洲诸国则只按照灵光的颜色来计算。
深海栖舰主要盘踞的区域是太平洋和大西洋，两洋的深海栖舰种类有着极大的不同。咖喱洋的深海栖舰数目则少得多，主要是从两洋与咖喱洋的交口处流动过去的。据推测，最早的大西洋深海栖舰几乎都源自地球的一战，而最早的太平洋深海栖舰几乎都源自地球的二战。虽然如此，二者的装备水平并没有代差。由于最早发现深海栖舰的是美国人，且深海栖舰的装备形制与英美舰娘的装备更加类似（很可能是因为两次世界大战时期英美的海军技术世界领先的缘故，不过也有与德国、意大利、法国、日本的舰娘装备类似的深海装备），因此深海栖舰的装备均采用英制单位（除了一些尚未实际测量过大小威力的高级品）。
大西洋的普通深海栖舰——排除了刚刚所说的基地和鬼姬之外——被英国人以发现的顺序逐一代入希腊数字，太平洋的普通深海栖舰则由于日美两国几乎同时发现，而有了两套不同的命名法：日本代入伊吕波歌的顺序，美国则代入希腊字母——如果希腊字母用完了再用拉丁字母，据说圣地亚哥的海军少将约书亚·约翰逊如此表示。
驱逐：
DDイ级（α型驱逐舰）日美均最早发现的深海栖舰，美方俗称“鲨鱼shark”
DDロ级（γ型驱逐舰）日2，美3，美方俗称“海豚dolphin”
DDハ级（δ型驱逐舰）日3，美4
DDニ级（ε型驱逐舰），日4，美5
轻巡：
CLホ级（ζ型轻巡洋舰），日5，美6，美方俗称“骷髅skull”
CLヘ级（η型轻巡洋舰），日6，美7
CLト级（ι型轻巡洋舰），日7，美9
CLツ级（τ型防空巡洋舰），日19，美19
雷巡：
CLチ级（θ型轻巡洋舰），日8，美8，美方俗称“万圣节Halloween”
重巡：
CAリ级（κ型重巡洋舰），日9，美10，美方俗称“骑士knight”
潜艇：
SSカ级（ξ型潜艇），日14，美14
SSヨ级（ν型潜艇），日15，美13
SSソ级（ο型潜艇），日18，美15
轻航：
CVLヌ级（π型轻航母），日10，美16
航母：
CVヲ级（ρ型航母），日12，美17
战列舰：
BBル级（μ型战列舰），日11，美12，美方俗称“屠夫slaughter”
BBタ级（λ型战列舰），日16，美11，美方俗称“女伯爵countess”
航空战列舰：
BBレ级（σ型战列舰），日17，美18，美方俗称“绞肉机mincer”
工作舰：
AFSワ级（β型运输舰），日13，美2，美方俗称“奶牛cow”
基地：
浮游要塞（floatingfortress）