开始还信心满满叶尔羌汗国骑兵，个个精神抖擞准备和明军决一雌雄。
可是在明军兵不血刃拿下六个卫后，他们都胆子都被吓破，急忙放弃哈密落荒而逃。
就这样，李岩和朱慈烺就会师哈密，明朝苦心经营一百多年的哈密，在历经几次来来回回后，终于再次回到华夏的怀抱。
哈密卫于永乐四年建造，哈密也由此成为明朝关西情报网的中心，“使为西域襟喉，凡夷使入贡者，悉令哈密译语以闻。
明朝如此重视哈密卫和帖木儿东征明朝不无关系。
帖木儿出发的消息不久既被明朝迤西情报网捕获。
故而永乐帝以甘肃总兵官节制除宁夏外整个陕西的军队，构建两道防线。
帖木儿东征明朝因其病逝于东征途中作罢。但帖木儿死后明朝还是没有放弃对帖木儿帝国的警惕，派遣锦衣卫抓捕购买当地人口的帖木儿商人。
又遣郑和率大军到达忽鲁谟斯停留长达五十二天之久，直到双方都冷静下来。
哈密卫的政务也由朝廷直接控制。哈密则以“诸番领袖”的地位，为朝廷“译诸番贡表，侦察向背”。
明朝加强哈密的控制，对钳制瓦剌、鞑靼、乌梁海也起了一定作用。
哈密位于新疆东部，是新疆通向中国内地的要道，自古就是丝绸之路的咽喉，有“西域襟喉，中华拱卫”和“新疆门户”之称。
哈密，地近甘肃，元代为甘肃行省的一部分。
在1370至1390年间，并入了若干蒙古属地。帖木儿也不得不称臣纳贡，所以帖木儿终身的梦想，就是在解除这个藩属关系。
洪武三年八月十日，故元高昌王和尚、岐王桑哥朵儿只班，以其所部来降。
洪武五年，冯胜西征，兵锋所指一路攻破西凉、永昌、甘州、亦集乃、肃州、瓜州、沙州。傅友德等人迫使原在此戍守的豳王逃往关西。
洪武十三年（1380年），都督濮英练兵西凉，请出师略地，开哈梅里之路以通商旅。太祖赐玺书曰：“略地之请，听尔便宜。然将以谋为本，尔慎毋忽。”英遂进兵。
土鲁番以联姻为名诱杀罕慎，复占哈密。明朝拘留土鲁番使臣，责令其悔罪，退还所侵之地。弘治四年，土鲁番归还哈密。
翌年，明朝立陕巴为忠顺王。六年，土鲁番主阿黑麻又出兵攻占哈密，执陕巴。时明朝兵部尚书马文升等人锐意兴复哈密。
八年，许进为甘肃巡抚，出兵收复哈密，仍以陕巴治理其地。但因屡受土鲁番的攻扰，难得宁居。直至十一年，明朝以王越总制三边军务兼经理哈密后，始趋于安定。
十八年，陕巴死，其子拜牙即嗣立。正德八年（1513），拜牙即投降土鲁番，哈密又为土鲁番所有终正德一朝，明朝虽先后派员、派兵兴复哈密，均未成功。
嘉靖初年，土鲁番多次兴兵攻扰肃州等地。明廷内部因大礼议之争，就收复哈密事掀起“封疆”之狱，处置了甘肃巡抚陈九畴等四十余人后，明朝最终失去对哈密的直接控制。