之后噶尔丹将目光转向东方，对喀尔喀蒙古即外蒙古地区诸部用兵。
喀尔喀蒙古诸部无法抵御噶尔丹，于是向清朝的康麻子求援。
1690年，噶尔丹亲率大军杀进入内蒙古地区，康麻子御驾亲征，双方在乌兰布通展开激战。清朝虽然获胜，但损失也很大，康麻子的舅舅佟国纲战死
之后，众叛亲离的噶尔丹自杀。噶尔丹虽死，但准噶尔没有灭亡，他的侄子策妄阿拉布坦继任首领。
策妄阿拉布坦在位期间，一方面继续西征，在准噶尔的打击下，哈萨克汗国分为大玉兹、中玉兹、小玉兹三部，均向准噶尔称臣，并派军占领了西藏地区。
在与东掳交战的同时，准噶尔部与沙俄帝国也一直处于战争状态。
当时沙俄国在额尔齐斯河设置了不少军事要塞，侵占准噶尔的领地。
1715年，准噶尔与沙俄在亚梅什交战，歼灭俄军1千多人，沉重打击了俄国的侵略气焰。
不过处于多线作战的准噶尔也为此付出代价，俄军趁准噶尔与东掳交战之际，还是侵占了不少领土。
策妄阿拉布坦死后，他的儿子噶尔丹策零继位，此时的准噶尔汗国依然强大，噶尔丹策零多次打败清军。
无奈之下，雍正帝与准噶尔议和，双方以以漠北杭爱山为界，以东属清，以西属准噶尔。
游牧帝国都有一个致命的缺点，它们必须有一位强大的首领，随着噶尔丹策零的死，准噶尔走向了衰落。
1745年，噶尔丹策零病死，汗国陷入争权夺位的内乱之中。
东掳看到了机会，再次对准噶尔用兵，于1755年活捉准噶尔汗达瓦齐，强盛一时、称霸中亚的准噶尔汗国至此灭亡。
现在准格尔并不是一个真正的汗国，名义上的大汗其实就是台吉而已。
直到准格尔出了一个大人物噶尔丹后，整个准格尔部落败强大起来。
此时土尔扈特还没有迁移，他们整个部族是亲大明的。
和硕部已经脱离准格尔成立和硕汗国，现在是反明五国之一，他们亲罗刹国。
另外几个部落内部意见都不统一，有人主张抗击大明，也有人主张保持现状，当然更多人主张向大明靠拢，毕竟大明现在如日中天。
准格尔台吉感觉已经有些力不从心，于是把台吉的位置传给了儿子僧格，而他已经躲在后方颐养千年了。
僧格是17世纪准噶尔部首领。巴图尔珲台吉的第五子。
1653年，由其父临终前指定为继承人。
历史上他抵御沙皇俄国的入侵。出兵攻打俄军哨所。
后来僧格被异母兄车臣台吉和卓特巴巴图尔谋杀，之后，他的六弟噶尔丹继位。
噶尔丹本是一个出家人，因为兄长被杀才临时还俗继位，正是他的继位才有准格尔的迅速强大直至称霸中亚。