就在马鸣风占领潼关，处置疫情期间，孙传庭也没有闲着，利用自己的职权四处征调兵力，十几天的功夫就集结了十三万大军。
这时候因为疫情的原因，李自成的大军已经解围而去，西安重新恢复到了原来的平静。
但是与之相应的，李自成在退走之后留下了一批身患疫情的军士，这些军士现在正在县城下，一个个疲弱不堪，举着白旗要向官军投降。
然而孙传庭没有治疗瘟疫的手段，同时也不能让这些人将瘟疫传染给西安城内外的军民，所以直接下令将这些身患瘟疫的闯军将士们射杀，然后烧了之后深埋。
在这之后孙传庭下令招兵买马，发展生产，购置武器，训练军士，组建火车营以应对李自成的骑兵，准备在半年之后与李自成的大军决战，如果疫情继续肆虐闯军的话，时间可以提前到三个月后。
然而令人无语的是，仅仅经过了三天，崇祯催促出兵的诏令就传了下来。
孙传庭本不予理会，然而催促出兵的诏令一道又一道，这让孙传庭没有办法，只能决定即刻出征迎敌。
这时候孙传庭麾下有自己亲自统辖的陕西兵，侯恂作为督师、左良玉作为主将的湖广兵，杨文岳作为总督的保定兵，还有陈士奇作为统帅、孔贞会作为主将的四川兵，蔡懋德作为统帅的山西兵，此外还有刘泽清的山东兵，朱大典的南京兵等力量，兵力虽然不少，可是却没有经过整训，彼此之间的默契极少，想要在与如臂使指的闯军对战中取胜实在有些不容易。
然而圣命难违，孙传庭也没有办法，于是决定按照皇帝的旨意，率军出征。
于是孙传庭下令留下一万将士守卫西安，同时传檄马鸣风协同守卫，随即率领十二万大军出发，前去会战闯军。
这时候的闯军已经来到了延安府，经过一番劫掠后休养生息，准备伺机反扑。
孙传庭听说消息之后，统率大军分三路北上迎敌，孙传庭以陕西兵、蔡懋德的山西兵以及朱大典的南京兵为中军，从西安往正北出发，经咸阳、泾阳、三原、富平、耀州、同官等地进入延安府，目标直指延安府的重镇鄜州；以侯恂的湖广兵和陈士奇的四川兵为西路，率军往西出发，经咸阳、醴泉、永寿、邠州，进入与延安府西邻的庆阳府，然后在庆阳府的宁州翻越横岭进入延安府，到鄜州与主力会合；东路则以杨文岳的保定兵、刘泽清的山东兵为主，自西安向东出发，经临潼，入渭南，至同州，澄城，翻越麻陂山进入延安府境内，占领洛川，进入鄜州与主力会合。
因为闯军都已经北撤，所以孙传庭的大军一路势如破竹，将被闯军占领的州县全都收复了。
数日之后，三路大军尽皆进入延安府境内。
然而就在进入延安府之后，各路大军就遭遇到了闯军。
首先是东路军，这一路军的力量本来就是最弱的，在孙传庭的计划中不过是奇兵而已，所起到的只是牵制和战略配合的作用。
然而没想到这一路军刚刚过了山口，却发现前面的一大片开阔地带，闯军的骑兵早已经准备就绪，随后那支骑兵往来纵横冲突，很快就东路军的阵型冲击得七零八落。