佐助的修炼依然在继续着，他要提高自己的实力之后再去草之国，具体提升到一个什么样的程度他说不清楚，毕竟一个人单独的修炼是有弊病的，那就是没有一个参考，也没有人指导，不过佐助有一个优势，或者说是穿越者的优势，那就是他可以清晰的知道很多事情，尤其是忍术的使用方式，开发起来也相对容易了很多。
他一直都在读书，尤其是上学的时候，大量的基础理论书籍了很多，就是为了今天，同时查克拉的控制也是炉火纯青的，那么剩下的就是研究忍术的手印了，十二种手印拥有千变万化的组合方式，但是不能随便的乱用，因为你不知道那些随便使用出来的组合会有什么样的效果，也许没有用处，也许会弄出一个大炸弹出来，这都是没准的事情，所以佐助的开发需要小心翼翼的，也不知道动漫里的佐助是怎么做到的。
佐助的忍术开发遇到了不小的困难，尤其是结印组合这里的困难很大，十二个手印确实不多，但是组合起来就太困难了，这都不是几次方的问题了，因为手印的重复使用让这个可能无限的放大了，忍术多的手印可以数十个，其中很多是重复使用的，这样的情况下想要开发新的忍术，首先你需要对手印有足够的了解，但是佐助恰恰忽略了这个问题，一直以来他都没有深入的研究过这个问题。任何发明创造都是要有基础的，忍术同样如此，结印速度自己练的不错，查克拉的控制也没有问题，但是手印的具体研究怎么就忽略了呢？
对于现在的情况佐助陷入了两难，但是再难也要进行下去的，不然忍术怎么开发，这种情况是他不能接受的，于是佐助一咬牙决定马上开始研究手印。首先是查克拉的运行轨迹来说了，让精神力和细胞中的能量汇聚丹田，应该是丹田吧，然后形成一个头、足、腹、胸、手再到头这么一个循环，流通所经过的经脉这个佐助是知道的，然后是就是单手结印，左手和右手结印的效果不同，分别控制着身体里面左右两边的经脉，佐助不是学中医的，不过学习医疗忍术的时候他知道了，人体的经脉名称。手三阴经、手太阴肺经、手厥阴心包经、手少阴心经、手三阳经、手阳明大肠经、手少阳三焦经、手太阳小肠经、足三阴经、足太阴脾经、足厥阴肝经、足少阴肾经、足三阳经、足阳明胃经、足少阳胆经、足太阳膀胱经，这是十二正经的名称。而手印对应的就是这十二种经脉了，而左右手结印都是这些经脉内查克拉的流动，而不同的手印组合在一起，就是让这些经脉中的查克拉不停的流动达到的一种效果，你结印的速度越快，那么产生的效果发生的越快。
根据这个原理佐助再次认真的研究了起来，还有他的过目不忘，研究起来的速度十分的快速，把不同的组合全部记住了，只有这样他可以在接下来的开发中得心应手。这个工作量有点儿大了，但是佐助不得不去研究，双手相同的手印是个什么样效果，双手不同的手印是什么样的情况，一点儿一点儿的慢慢来，他不怕浪费时间，而且他一次就可以记住这些变化和不同，这给了他新的希望，同样这种研究更加增强了他查克拉的控制能力，同时一些小发现让他十分的惊喜，因为一直以来他都是温养全身的经脉，这让他的经脉都十分的坚韧和宽阔，一个手印调动的查克拉可以扩展开了，调动更多经脉中的查克拉，使得忍术的威力可以增强，也可以减小，但是工作量又大了不少。
同时佐助每天把自己的观察和发现全部的记录下来，他准备以后弄个宇智波佐助忍法帖，将自己会的东西全部收录进去，这也算是青史留名了吧？外界的一切都和佐助没有关系了，他现在成了一个‘科学狂人’，废寝忘食的研究着。他的做法让团藏十分的郁闷，找不到佐助的踪迹了，虽然他现在可以动用的人手有限，但是也不应该完全找不到的，云忍村和雾忍村的事件，他都是怀疑的对像，虽然没有证据，但是怀疑是不需要证据的，所以现在他被盯死了，完全动弹不得，而三代火影完全不管事儿了，就算是团藏去找三代都没有用处，三代火影直接闭门不见。
而‘根’的成员一部分上交了名单，这些人基本上都是团藏并不看重的，纲手借着各种的理由开始给他们分配任务，你可以不去，但是马上就会成为叛忍，直接杀了你都没有问题，同时一大批纲手的旧部得到了启用，自来也的旧部也同样如此，要知道，他们两人和大蛇丸曾经都是木叶的指挥官的，大蛇丸都有死忠呢，别说他们两个了。卡卡西、迈特凯这些上忍们很多都在他们三人麾下战斗过的，同时一些家族的现任族长以前也在他们手下干过，鹿丸的父亲鹿久就是其中的代表人物，直接成了纲手的参谋。
同时，纲手借助佐助的两次遇袭事件，直接拿下了涡之国的管理权，开始派人去接管了，这里十分的富足，同时对于木叶的忍者没有什么芥蒂，平民很欢迎木叶接管这里，他们不过是交点税而已，但是安全得到了充足的保证，木叶直接在这里设立的基地。涡之国的大名和忍者村已经没有了，接管这里没有丝毫的阻碍，纲手直接下令在这里建立一个基地，正好隔绝了火之国和水之国，形成了一道海上防线。而且这里的税收直接归到了木叶，而不是火之国的大名，木叶的收入增加了不少，这让纲手的声望一时无两，团藏想要对抗也不可能了。
宇智波佐助并不知道他给木叶带来的变化，依然沉浸在漫长的研究里面，很有大蛇丸的风范了，现在佐助知道动漫中为什么佐助可以快速的开发忍术了，因为大蛇丸多年的研究对他的帮助太大了，加上药师兜这个出色的医疗忍者，想不快都难啊，但是他根本不想去，那里太恶心了，没错，佐助就怕恶心。