就在冯立与薛实、宇文宝等人，率两千精锐赶到玄武门之时，那段志玄依靠过人的臂力，竟独自关闭了大门，并将冯立等人是挡在了玄武门之外。
不过玄武门的守将云麾将军敬君弘，并未将这些东宫侍卫放在眼里，所以他毅然地站了出来，并准备出城门去迎战这些东宫侍卫。
可有部将劝说他道：“将军，现在事情并未见分晓，不如留下来观察事态的发展变化。同时也可等到兵力汇集到一起后，并组成阵列，再出玄武门迎战也不迟啊。”
可敬君弘听不进别人的劝说，并与中郎将吕世衡一起是冲出了玄武门。可惜他低估了长林军的战斗力，再与长林军厮杀了一阵后，敬君弘与他的宿卫军们是尽没在了长林军的手中。
当冯立又指挥长林军向玄武门发起进攻时，却遭到了守军们的顽强抵抗。经过一个多时辰的进攻，长林军依然没有攻破玄武门，使得冯立在老羞成怒之下，并召回大军准备进攻秦王府。
可就在冯立重新集结大军之时，侯君集则提着李建成和李元吉的首级是登上了城墙。当东宫和齐王府的人马再看到李建成和李元吉的人头时，顿时就失去了战心，并迅速地就溃散了开来。而冯立在杀了敬君弘后，便对自己的部下说道：“我等已经尽力了，也算是报答了太子殿下的恩德，从此尔等就自行散去，这天下也已经与我们无关了。”冯立在说完这番话后，是丢掉武器落荒而逃。至此，这场政变以秦王李世民的胜利而告终。
而就在政变发生的时候，李渊竟还在宫内的海池上划船。当李世民让侯君集等人入宫，并担任了警卫后，这才身披铠甲、手握长予地来到了李渊的游船上。
当李渊看到李世民那杀气腾腾的样子时，顿时是大惊地问道：“世民，你这是为何？难道宫中还有人作乱不成？”
李世民向李渊施了一礼后，并说道：“儿臣因为太子和齐王的作乱，所以才起兵诛杀了他们。儿臣担心那些叛逆会惊扰到父皇，所以特派儿臣的部下担任了宫中的警卫，还望父皇恩准。”
此时李渊的身边也有几位大臣，如裴寂、陈叔达、孔颖达、李纲、窦轨等人。当李渊听到李世民已斩杀了李建成和李元吉后，不由得是心里一痛，同时一丝不好的预感也涌上了心头。
当李渊故作镇定地询问其他几位大臣，该如何处理此事时，陈叔达与孔颖达连忙站出来说道：“太子与齐王本就平庸，而且又没有为我大唐立下什么功劳，所以他们才会嫉妒秦王的功劳与威望，并一起策划了这场叛逆的阴谋。