原来在洪荒年代，神农游历神州采药炼丹，治病救人，在无意中于此处发现了当初还是初生幼苗的混沌神树。看到如此的先天灵宝神农帝当然心动了，于是就决定在此隐居，等待混沌神树长成的那天。
不过后来黄帝和蚩尤的那场大战，神农也被迫卷入了战争，不过他通过先天神术的推算，知道自己在那场大战中将会有劫难，而混沌神树也将会为一个身负天命的人所得，所以神农就在混沌神树周围布下了幻阵，让进入这片森林的不能够深入到这里，能够进入这里
而他在混沌神树下则开辟了这样一个空间，把自己的随身法宝神农鼎放在了这里，用以吸收这里地下灵脉的灵气，来加快混沌神树的成长。
而那篇神诀则是神农在洪荒大地游历时偶然得到的，，所以神农就把它留在了这里，心中想的是或许这也是留给那个身负天命之人的东西，因此就把全本留了下来，而把第一层流传了出去。
而那场大战虽然最终黄帝取得了胜利，但战争中却让弱小的人类遭受了巨大的毁灭，因此当时的几位圣人和女娲大神联手将除人类的各种族迁移到了天界，并对地球进行了封印。
“事情的经过就是这样了，你现在看到的不过是我留在混沌神诀上的一丝分身意识，你能得到修炼成混沌神诀的第一层，并且得到混沌神树，证明你就是那个身具天命之人，希望你能肩负起你的使命。我的神农鼎以及我写的《神农经》也留给你了，希望你能好好利用它。还有，虽然地球遭到封印，但是还是留下了一个传送站的，等你地球的事情完成之后，希望你能通过传送阵来天界，因为这里还有你要做的事情在等着你来完成。”说完这些，神农的那丝意识分身也就消散了。
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